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김근중 교수

Laboratory: 분자 미생물학 실험실 (산업미생물학)

연구실: 자연대 1호관 327호

연락처: 062-530-3403

이메일: gjkim@jnu.ac.kr

세부내용

연구실원 (Fellow & Researchers, Doctoral Graduate Students, Masters-level Graduate Students, Undergraduate Students, Key Alumni)
- Doctoral Graduate Students
  - 이 진 영 : 미니셀을 이용한 약물전달 시스템 구축
  - 최 은 실 : 미생물을 이용한 천연염료 생산공정 개발
  - 민 사 영 : Quorum sensing을 이용한 항암단백질 자가발현 모듈 제작
  - 임 호 동 : 새로운 단백질 발현 논리를 적용한 유전자 회로 제작
  - 유 성 환 : 조효소 정량과 탐침을 위한 초정밀 분석 시스템 설계
  - 이 선 : 석·박사 통합과정
  - 안 승 현 : 산학연계 박사과정
  - 서 민 경 : 산학연계 박사과정
- Masters-level Graduate Students
  - 김 정 일 : 산학 연계 석사과정
- Undergraduate Students
  - 한 소 영 : 방향적 인공진화를 통한 β-glucosidase 특성 개량
  - 이 은 별 : 조효소 의존적 분자 진단 시스템
  - 조 수 현 : 이소프레노이드 생합성 효소 안정성 조율
  - 고에스더 : 질환 치료용 유전자 회로 개발
  - 김 도 예 : 질환 치료용 단백질 발현 모듈 개발
연구 분야 (RESEARCH INTERESTS)
연구 논문 (SELECTED PUBLICATIONS)
- 2010년
  - Generation of a fast maturating red fluorescent protein by a combined approach of elongation mutagenesis and functional salvage screening. Biochemical and Biophysical Research Communications 391(1): 598-603.
  - Characterization of an indican-hydrolyzing enzyme from Sinorhizobium meliloti. Process Biochemistry 45(6): 892-896.
  - Trends in protein engineering for gene targeting: homing endonucleases and zinc finger nucleases. KSBB J. 25(3): 215-222.
  - Prediction of ORFs in metagenome by using cis-acting transcriptional and translational factors. KSBB J. 25(5): 490-496.
  - Screening of functional promoter from metagenomic DNA for practical use in e-x-p-r-e-s-s-i-o-n systems. Method in Molecular Biology (Book chapter in Metagenomics-methods and protocols) 668: 141-152.
  - Construction of a T-vector using an esterase reporter for direct cloning of PCR products. Journal of Microbiology and Biotechnology 20(11): 1481-1483.
- 2011년
  - A coupling process for improving purity of bacterial minicells by holin/lysin. J Microbiol Methods 86(1): 108-110.
  - Screening and identification of a novel esterase EstPE from a metagenomic DNA library. Journal of Microbiology 49(1): 7-14.
  - Production of natural indirubin from indican using non-recombinant Escherichia coli. Bioresource Technology 102(19): 9193-9198.
  - Prediction of genes lacking in an ammonia oxidizing archaeon for independent growth. KSBB J. 26(3): 237-242.
  - A novel bifunctional endo-/exo-type cellulase from an anaerobic ruminal bacterium. Applied Microbiology and Biotechnology 89(5): 1453-1462.
  - Biocontrol of moth pests in apple Orchards: preliminary field study of application potential for mass trapping. Biotechnology and Bioprocess Engineering 16(1): 153-157.
  - Antimicrobial activity of delaminated aminopropyl functionalized magnesium phyllosilicates. Applied Clay Science 53(4): 729-736.
  - Purification and characterisation of an alkaliphilic esterase from a culinary medicinal mushroom, Sparassis crispa. Food Chemistry 124(4): 1376-1381.
  - Enrichment and characterization of an autotrophic ammonia-oxidizing archaeon of mesophilic Crenarchaeal Group I.1a from an agricultural soil. Appl Environ Microbiol 77(24): 8635-8647.
- 2012년
  - A cloning vector employing a versatile beta-glucosidase as an indicator for recombinant clones. Analytical Biochemistry 425(2): 166-168.
  - Screening of a highly soluble and oxygen-independent blue fluorescent protein from metagenome. Biochemical and Biophysical Research Communications 419(4): 676-681.
  - Cultivation of a highly enriched ammonia-oxidizing archaeon of thaumarchaeotal group I.1b from an agricultural soil. Environmental Microbiology 14(6): 1528-1543.
  - Identification and characterization of a novel cold-adapted esterase from a metagenomic library of mountain soil. Journal of Industrial Microbiology & Biotechnology 39(5): 681-689.
  - Purification and Characterization of an Indican-hydrolyzing β-glucosidase from Agrobacterium tumefaciens KSBB J. 27 27(6): 341-346
- 2013년
  - Construction of non-invasively constitutive e-x-p-r-e-s-s-i-o-n vectors using a metagenome-derived promoter for soluble e-x-p-r-e-s-s-i-o-n of proteins. Bioprocess and biosystems engineering 36(6): 667-676.
  - A simple bacterial transformation method using magnesium- and calcium-aminoclays. Journal of microbiological methods 95(2): 97-101.
  - Improved cell disruption of Pichia pastoris utilizing aminopropyl magnesium phyllosilicate (AMP) clay. World journal of microbiology & biotechnology 29(6): 1129-1132.
  - Analysis and enrichment of microbial community showing reducing ability toward indigo in the natural fermentation of indigo-plant. KSBB J. 28(5):295-302
- 2014년
  - Anti-tumoral effect of the mitochondrial target domain of Noxa delivered by an engineered Salmonella typhimurium. PLoS One 9(1): e80050.
  - Oxidative biodegradation of single-walled carbon nanotubes by partially purified lignin peroxidase from Sparassis latifolia mushroom. J. ind. Eng. Chem. DOI: 10.1016/j.jiec.2013.12.022 (in press)
강의 (COURSES or COURSES TAUGHT)
- 메타제노믹스 (Metagenomics)
  - 21세기 새로운 생물자원으로 잠재성이 매우 큰 metagenome 자원의 효율적인 이용방법과 관련 연구기법 및 분리된 유전체로부터 목적하는 자원을 발굴하기 위한 목표 지향적 선별법에 관해 소개하고 이들 자원을 이용한 새로운 연구방향과 흐름에 관해 소개한다.
- 분자 생물 공학 (Molecular Biotechnology)
  - 분자생물공학 기술 원리 및 방법, 재조합 유전자의 발현 및 조절, 유용유전체의 탐색 및 분리, 전사된 유전물질 혹은 발현된 단백질의 탐색 및 특성개량, 바이오 의공학, 진단시약 등을 포함하는 분자생물공학 전반에 관해 토론한다.
- 미생물 생리학 (Microbial Physiology)
  - 진핵생물의 세포현상, 유전, 생리학의 근간이 되는 미생물 생리에 관한 내용을 주된 연구대상인 대장균을 포함하여 일반적인 다른 세균에서 유래된 정보까지를 포괄적으로 학습 한다.
- 단백질 인공진화 (Artificial evolution of proteins)
  - 의학, 산업, 진단, 치료 목적으로 폭 넓게 이용되는 단백질(효소)자원은 생태계에서 직접 선별하거나, 기존 자원을 목적에 맞게 개량한 후 활용 되고 있다. 이처럼, 목적에 맞게 개량되는 단백질의 인위적 인공진화가 지닌 기술적 특성과 한계, 미래전략, 구조 기반의 rational approach 와 무작위적인 random approach 의 상호보완적인 특성을 단백질 고유의 functional space 와 mutational tolerance 관점에서 소개한다.